Honeynets zijn een belangrijk middel bij het traceren en analyseren van de manier waarop aanvallers te werk gaan. Inmiddels zijn er verschillende honeynet tools, maar de bekendste software toch wel afkomstig van het Honeynet Project, de non-profit organisatie die in 1999 werd opgericht. Het Internet Storm Center bekeek een aantal nieuwe en verbeterde programma's, zoals HoneySnap, Nepenthes malware collector, Honeywall en het Mitre Honeyclient project.